Books by Andreas Gogol-Doring

Dieses Buch führt Sie sachte in die Denkweisen des Fachs "Algorithmen und Datenstrukturen" ein. Es erklärt Informatik-Anfängern Terminologie, Notation und zentrale Inhalte des Fachgebiets auf anschauliche und sehr unterhaltsame Weise. Ein Fokus sind die Techniken und Tricks, die Sie brauchen, um effiziente Algorithmen und Datenstrukturen zu bauen. Sie werden auch in die Lage versetzt, Pseudocode in der typischen akademischen Darstellung zu verstehen und in unterschiedlichen Programmiersprachen zu realisieren oder umgekehrt grundlegende algorithmische Ideen als Pseudocode zu dokumentieren.

Written by SeqAn project founders, this book describes the general library design of SeqAn. It introduces biological sequence analysis problems, discusses the benefit of using software libraries, summarizes SeqAn design principles and goals, details SeqAn programming techniques, and demonstrates the application of these techniques in various examples. Focusing on SeqAn components, the second part explores basic functionality, sequence data structures, alignments, pattern and motif searching, string indices, and graphs. The last part describes applications of SeqAn to genome alignment, consensus sequence, suffix array construction.

The SeqAn project was initiated to offer access to the algorithms needed by researchers in computational biology and bioinformatics. This book helps you in rapid prototyping of algorithms in the field. It is suitable for bioinformaticians.